- SMA Negeri 1 Tanjung Karang, Bandar Lampung, lulus tahun 1991
- Diploma III (D3) di Sekolah Tinggi Pemerintahan Dalam Negeri (STPDN) Jatinangor, tahun 1994
- Sarjana (S1) di Institut Ilmu Pemerintahan (IIP) Jakarta, lulus tahun 1999
- Magister (S2) Ilmu Pemerintahan di Universitas Padjadjaran, lulus tahun 2003
- Doktor (S3) Ilmu Pemerintahan di Universitas Padjadjaran, lulus tahun 2009
Karir
Karier Agus Fatoni bermula sebagai ajudan Gubernur/Kepala Daerah Tingkat I Lampung pada 1995-1997.
Ia kemudian bertugas di Kementerian Dalam Negeri (Kemendagri) dan menjabat sebagai:
- Kepala Staf Pribadi Mendagri
- Kepala Subdit Dana Bagi Hasil Pajak, Migas, dan Cukai pada Direktorat Fasilitasi Dana Perimbangan Kemendagri
- Kepala Seksi Provinsi Papua dan Daerah Istimewa Yogyakarta pada Subdit Otonomi Khusus Ditjen Otonomi Daerah Kemendagri
- Pjs Gubernur Sulawesi Utara, menggantikan Olly Dondokambey, pada 26 September 2020-5 Desember 2020
- Kepala Badan Penelitian dan Pengembangan Kemendagri
- Sekretaris Direktorat Jenderal Bina Keuangan Kemendagri
- Kepala Biro Administrasi Pimpinan Kemendagri