Dia menyelesaikan sekolah dasar di SD Negeri 1 Sukabumi, Bahuga, Kabupaten Way Kanan (1985), Fatoni kemudian melanjutkan ke SMP Negeri 1 Bahuga, Kabupaten Way Kanan dan lulus 1988.
Setelah itu Fatoni melanjutkan sekolah di SMA Negeri 1 Tanjung Karang, Bandar Lampung, tamat tahun 1991.
Lulus SMA, Fatoni mendaftar menjadi Praja Sekolah Tinggi Pemerintahan Dalam Negeri (STPDN).
BACA JUGA:Film Drakor yang Baru Tayang di Netflix, Banyak Genre Tinggal Pilih Sesuai Selera
Dia berhasil menyelesaikan program D3 di STPDN Jatinangor tahun 1994.
Lantas dia melanjutkan pendidikan Sarjana (S1) jurusan Kebijakan Pemerintah, Institut Ilmu Pemerintahan (IIP) Jakarta lulus tahun 1999.
Fatoni juga menyelesaikan pendidikan Magister (S2) Ilmu Pemerintahan di Universitas Padjadjaran lulus tahun 2003 dan Doktor (S3) Ilmu Pemerintahan di Universitas Padjadjaran, lulus tahun 2009.
Pada tahun 2020, Mendagri Tito Karnavian menunjuk Agus Fatoni menjadi Pejabat Sementara (Pjs) Gubernur Sulawesi Utara.
BACA JUGA:Mengamankan Pilkada Lampung, Danrem Gatam Siap Dukung dan Berkolaborasi
Upacara penyerahan SK dilaksanakan oleh Mendagri kepada Fatoni dilaksanakan Jumat 25 September 2020 bertempat di Kemendagri.
Fatoni bertugas sebagai Penjabat Sementara (Pjs) Gubernur Sulawesi Utara sampai dengan 5 Desember 2020 lantaran Gubernur Olly Dondokambey ambil cuti kampanye Pilkada serentak Tahun 2020 Provinsi Sulawesi Utara.
Pelantikan Pj Gubernur Sumsel dikabarkan secara berbarengan dengan pelantikan Pj Gubernur Sumut dan Pj Gubernur Nusa Tenggara Barat (NTB).
“Betul, Senin nanti dijadwalkan pelantikan Pj Gubernur Sumsel dan 2 pj Gubernur lainnya,” tegas Kepala Biro Otonomi Daerah (Otda) Sumsel, Sri Sulastri, Sabtu, 22 Juni 2024.
BACA JUGA:10 Game PC dan Android Penghasil Uang, Langsung Tarik Lewat E-Wallet